广州白云空港综合保税区拟选址地总面积7.198平方公里，跨广州白云、花都两区，分南区、中区和北区三个区域，是国内较大的空港综合保税区，其中“一园三区”的主体部分南区位于白云区钟落潭镇白云空港高新科技产业基地，面积为4.53平方公里（占广州白云空港综合保税区的六成面积），距离广州白云国际机场约5.5公里，距离白云国际机场*三跑道约5公里，距离联邦快递亚太转运中心约4.8公里。该地块东临京珠高速路，北部将与规划中的机场东环路与联邦快递亚太转运中心连接，西部经规划中的白云六线与机场相连，同时与区内多条高速公路紧密联系：距离京珠高速公路约3.5公里，距离北二环高速路约5公里，距离机场高速路约7公里；还有地铁九号线和十四号线贯穿其中，交通相当便利。南区是将以保税加工和保税贸易为主，以配套保税物流和服务贸易为辅的区域。